L’origen del Santíssim Misteri es troba en una de les grans joies de l’art medieval català conservades al monestir: el Davallament de la Creu, un extraordinari conjunt escultòric realitzat a mitjan segle XIII. Set figures de fusta de cirerer policromada representen l’escena del davallament de Jesús: Crist ocupa el centre, encara clavat a la creu però amb un braç ja desclavat, envoltat de Josep d’Arimatea, Nicodem, la Mare de Déu, sant Joan Evangelista i els dos lladres, Dimes i Gestes.
El conjunt fou solemnement consagrat l’any 1251. D’acord amb una pràctica habitual a l’edat mitjana, a l’interior de les imatges s’hi dipositaren relíquies. En la figura de Crist es practicaren dues petites cavitats, una de les quals, situada al front, va acollir una Sagrada Forma embolcallada amb trosset de lli i protegida rere una làmina metàl·lica.
Aquella hòstia va romandre oculta durant gairebé dos segles. L’estiu de 1426, mentre es restauraven les figures del Davallament, els operaris descobriren al front de Crist la petita placa metàl·lica. En retirar-la, aparegué l’embolcall de lli i, al seu interior, la Sagrada Forma, dividida en tres fragments però conservada malgrat els 175 anys transcorreguts.
Els canonges van consultar aleshores els antics llibres del monestir i comprovaren que es tractava de la mateixa hòstia dipositada en la consagració de 1251. Segons la tradició, quan els habitants de la vila foren convocats per a contemplar la troballa, l’admiració els feu exclamar: «Santíssim Misteri!» Aquella expressió acabaria donant nom tant al conjunt escultòric com a una devoció que ben aviat va atreure pelegrins d’arreu del país.
La commemoració del sisè centenari va començar el divendres dia 17 de juliol, coincidint exactament amb l’aniversari de la troballa. En la missa inaugural, es llegí íntegrament l’acta que dona testimoni del descobriment i es cantaren els goigs.
El diumenge següent va tenir lloc la celebració central, amb una missa solemne presidida per Mn. Josep Maria Riba, vicari general. En la seva homilia, interpretà també l’esdeveniment de 1426: «Fa 600 anys la contemplació i la recerca d’una gran peça artística remou els cors i obre els ulls a una comunitat que experimenta una veritable conversió de cor, que els porta a una conversió des de Crist i en Crist.» Mn. Riba va convidar també a mirar el Santíssim Misteri no solament com un llegat rebut del passat, sinó com una crida per al present. En una societat on es debiliten els mecanismes tradicionals de transmissió familiar, religiosa, política i cultural, recordà que «el futur del cristianisme a casa nostra està en mans de Déu».

